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Smile. Tomorrow will be worse.

   

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Lecture Materials(2018-2020)

Workshop Materials
Python 初心者講習会@農研機構・岩手盛岡 (2020-10)
プログラミング言語未経験者を対象とした Python ハンズオン講習会。内容は、Python 文法(リスト・ディクショナリ・関数・基本構文・文字列処理・ファイル処理)、パッケージ(NumPy・Pandas・matplotlib)の使い方など。
Python 入門
ゲノム解析勉強会 (2020-08) online
第二世代シーケンサーのデータ解析についての内容。RNA-Seq データを利用した発現変動遺伝子の検出および DNA-Seq データを利用した short variants の検出を中心に取り上げる。
資料 / 実習資料(発現量定量 / 発現量解析 / GWAS 実習資料
農学生命情報科学特論 I @東京大学アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット (2020-06)
プログラミング言語未経験者を対象とした Python 入門講義。農学や分子生物学などの分野で利用される Python の最新事例を紹介しながら、Python の基礎文法の講義を行う。
第 1 回 / 第 2 回 / 第 3 回 / 第 4 回
Python 初心者講習会@京都府農林水産技術センター (2020-02)
プログラミング言語未経験者を対象とした Python 入門講習会および機械学習ワークフローの紹介。
Python 初心者講習会@農研機構・広島福山 (2020-02)
プログラミング言語未経験者を対象とした Python ハンズオン講習会。内容は、Python 文法(リスト・ディクショナリ・関数・基本構文・文字列処理・ファイル処理)、パッケージ(NumPy・Pandas・matplotlib)の使い方など。
機械学習勉強会@農研機構・つくば (2020-01)
機械学習の手法の全体像を掴むために、教師あり学習(回帰問題、分類問題)、教師なし学習(次元削減・クラスタリング)などの内容を取り上げる。各項目を深入りせずに、できるだけ機械学習とその周辺の概要を把握できるような構成。
機械学習入門 / ノート(
分類, モデル評価, 回帰分析, クラスタリング, 物体分類
Python 初心者講習会@農研機構・北海道札幌 (2019-10)
先進ゲノム支援 情報解析講習会@遺伝研・三島 (2019-10)
Python 中級者を対象とした塩基配列解析&機械学習講習会の視覚化部分。内容は、matplotlib および seaborn による視覚化。
R 講習会(tidyverse)@農研機構・つくば (2019-09)
dplyr/tidyr などを利用したデータの操作方法、ggplot2 を利用したグラフの作成方法などに関する内容。
Python 講習会(Pandas 実践)@農研機構・つくば (2019-09)
Pandas を使用した行列(データフレーム)の結合、グループ演算、データ視覚化、表データのマークアップなどに関する内容。
Python 初心者講習会@農研機構・熊本合志 (2019-08)
Python 講習会@農研機構・香川生野 (2019-07)
R 初心者講習会@農研機構・つくば (2019-07)
プログラミング言語未経験者を対象とした R ハンズオン講習会。内容は、R 文法(オブジェクト・関数・基本構文・文字列処理・ファイル処理・グラフ・回帰分析・主成分分析)。
Python 初心者講習会@農研機構・つくば (2019-06)
Python 初心者講習会@農研機構・つくば (2019-02)
先進ゲノム支援 情報解析講習会@遺伝研・三島 (2018-11)