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Python for Bioinformatics

Contents Materials Videos
1. プログラミング言語概要

  • プログラミング言語
  • データとアルゴリズム
資料 解説(45 分)
2. Python 実行環境構築

  • Python 実行環境(Anaconda / pyenv)
  • Jupyter notebook
  • テキストエディタ
資料 解説(45 分)
演習(30 分)
3. データ型

  • 変数
  • リスト
  • ディクショナリ
  • タプル
  • セット
資料 解説(70 分)
4. 基本文法

  • if 構文
  • for 構文
  • while 構文
  • 関数
資料 解説(95 分)
5. テキスト処理

  • 文字列
  • ファイル処理
  • 正規表現
資料 データ 解説(90 分)
6. 数値計算

  • NumPy(配列)
7. データ処理

  • Pandas(シリーズ・データフレーム)
  • 表データ処理
8. データ可視化

  • matplotlib
  • seaborn
9. バイオインフォマティクス

  • biopython
  • 塩基配列処理
  • フラットファイル処理
10. オブジェクト指向

  • 例外処理
  • クラス
  • イテレータ


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